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Ricardo Silveira
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ciência aberta

tetrapoDNA

Quais anfíbios, répteis, aves e mamíferos do Brasil ainda não têm nenhuma sequência de DNA pública?

~4.800espécies conferidas
2bases de sequências (BOLD e GenBank)
semanalatualização

Um painel público confere toda semana cada espécie das listas oficiais contra o BOLD e o GenBank e ordena as lacunas por grau de ameaça e endemismo.

O pipeline em R checa sinônimos no Catálogo Taxonômico da Fauna do Brasil e no GBIF antes de declarar uma lacuna: uma espécie que mudou de gênero não pode aparecer como “sem DNA” só porque a sequência está sob o nome antigo.

Pesquisadores podem adotar publicamente uma espécie para sequenciar, o que transforma a lista de lacunas numa fila de trabalho.

A ideia nasceu no meu pós-doutorado na UFRN, junto ao PPBio (2022–2023), onde montei o pipeline das listas de vertebrados e da cobertura de dados genéticos. O tetrapoDNA é a versão completa e pública desse trabalho.

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